MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015574	A	6	6	249125	249130	100 %	0 %	0 %	0 %	333986457
4002	NC_015574	TAA	2	6	249170	249175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986457
4003	NC_015574	AGG	2	6	249192	249197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986457
4004	NC_015574	ATA	2	6	249241	249246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986457
4005	NC_015574	GTT	2	6	249280	249285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986457
4006	NC_015574	CTT	2	6	249291	249296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986457
4007	NC_015574	ATAA	2	8	249337	249344	75 %	25 %	0 %	0 %	333986457
4008	NC_015574	AGAAAG	2	12	249396	249407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986458
4009	NC_015574	CCA	2	6	249447	249452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986458
4010	NC_015574	A	6	6	249537	249542	100 %	0 %	0 %	0 %	333986458
4011	NC_015574	TAA	2	6	249554	249559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986458
4012	NC_015574	TC	3	6	249604	249609	0 %	50 %	0 %	50 %	333986458
4013	NC_015574	TAAT	2	8	249727	249734	50 %	50 %	0 %	0 %	333986458
4014	NC_015574	TAA	2	6	250215	250220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986459
4015	NC_015574	TAA	2	6	250293	250298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986459
4016	NC_015574	A	6	6	250323	250328	100 %	0 %	0 %	0 %	333986459
4017	NC_015574	A	6	6	250342	250347	100 %	0 %	0 %	0 %	333986459
4018	NC_015574	ATT	2	6	250417	250422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986460
4019	NC_015574	TTC	2	6	250475	250480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986460
4020	NC_015574	AGA	2	6	250516	250521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986460
4021	NC_015574	TTCC	2	8	250532	250539	0 %	50 %	0 %	50 %	333986460
4022	NC_015574	AGG	2	6	250546	250551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986460
4023	NC_015574	GGT	2	6	250613	250618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986460
4024	NC_015574	GCA	2	6	250682	250687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986460
4025	NC_015574	GTTA	2	8	250702	250709	25 %	50 %	25 %	0 %	333986460
4026	NC_015574	TAA	2	6	250710	250715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986460
4027	NC_015574	CAA	2	6	250749	250754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986460
4028	NC_015574	ATG	2	6	250772	250777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986460
4029	NC_015574	CAAG	2	8	250778	250785	50 %	0 %	25 %	25 %	333986460
4030	NC_015574	TAA	2	6	250812	250817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986460
4031	NC_015574	GTAATG	2	12	250898	250909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986460
4032	NC_015574	GA	3	6	250933	250938	50 %	0 %	50 %	0 %	333986460
4033	NC_015574	A	6	6	250938	250943	100 %	0 %	0 %	0 %	333986460
4034	NC_015574	ATG	2	6	251094	251099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986460
4035	NC_015574	ACA	2	6	251204	251209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986460
4036	NC_015574	GCT	2	6	251273	251278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986460
4037	NC_015574	GGA	2	6	251344	251349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986460
4038	NC_015574	A	6	6	251379	251384	100 %	0 %	0 %	0 %	333986460
4039	NC_015574	TGT	2	6	251452	251457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986460
4040	NC_015574	AG	3	6	251884	251889	50 %	0 %	50 %	0 %	333986461
4041	NC_015574	GAAA	2	8	251911	251918	75 %	0 %	25 %	0 %	333986461
4042	NC_015574	CA	3	6	251925	251930	50 %	0 %	0 %	50 %	333986461
4043	NC_015574	ATC	2	6	251957	251962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986461
4044	NC_015574	ACC	2	6	252083	252088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986461
4045	NC_015574	TGT	2	6	252145	252150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986461
4046	NC_015574	ACC	2	6	252192	252197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986461
4047	NC_015574	TCAT	2	8	252198	252205	25 %	50 %	0 %	25 %	333986461
4048	NC_015574	AAG	2	6	252211	252216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986461
4049	NC_015574	ACA	3	9	252246	252254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986461
4050	NC_015574	TGG	2	6	252268	252273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986461
4051	NC_015574	A	6	6	252445	252450	100 %	0 %	0 %	0 %	333986461
4052	NC_015574	ACTT	2	8	252491	252498	25 %	50 %	0 %	25 %	333986461
4053	NC_015574	ATG	2	6	252533	252538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986461
4054	NC_015574	A	6	6	252566	252571	100 %	0 %	0 %	0 %	333986461
4055	NC_015574	AAG	2	6	252636	252641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986461
4056	NC_015574	AAT	2	6	252780	252785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986462
4057	NC_015574	AGG	2	6	252873	252878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986462
4058	NC_015574	AGAAC	2	10	252886	252895	60 %	0 %	20 %	20 %	333986462
4059	NC_015574	TGA	2	6	252906	252911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986462
4060	NC_015574	GAT	2	6	252988	252993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986462
4061	NC_015574	ATA	2	6	253015	253020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986462
4062	NC_015574	AGC	2	6	253194	253199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986462
4063	NC_015574	AGC	2	6	253269	253274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986462
4064	NC_015574	GGAA	2	8	253340	253347	50 %	0 %	50 %	0 %	333986463
4065	NC_015574	AAG	2	6	253384	253389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986463
4066	NC_015574	AGG	2	6	253466	253471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986463
4067	NC_015574	AGA	2	6	253514	253519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986463
4068	NC_015574	TTG	2	6	253549	253554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986463
4069	NC_015574	TTG	2	6	253560	253565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986463
4070	NC_015574	A	6	6	253629	253634	100 %	0 %	0 %	0 %	333986463
4071	NC_015574	TAA	2	6	253639	253644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986463
4072	NC_015574	GGT	2	6	253659	253664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986463
4073	NC_015574	ATT	2	6	253714	253719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986463
4074	NC_015574	TGA	2	6	253730	253735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986463
4075	NC_015574	AAT	2	6	253785	253790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986463
4076	NC_015574	GGC	2	6	253901	253906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986463
4077	NC_015574	TGA	3	9	253925	253933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986463
4078	NC_015574	A	7	7	253948	253954	100 %	0 %	0 %	0 %	333986463
4079	NC_015574	GGT	2	6	254109	254114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986463
4080	NC_015574	ATC	2	6	254117	254122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986463
4081	NC_015574	GAT	2	6	254217	254222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986463
4082	NC_015574	GTG	2	6	254230	254235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986463
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4084	NC_015574	GGA	2	6	254357	254362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986463
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4086	NC_015574	GAAGAG	2	12	254824	254835	50 %	0 %	50 %	0 %	333986464
4087	NC_015574	TAA	2	6	254878	254883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986464
4088	NC_015574	TCT	2	6	254902	254907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986464
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4090	NC_015574	ATG	2	6	255053	255058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986464
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4092	NC_015574	AT	4	8	255135	255142	50 %	50 %	0 %	0 %	333986464
4093	NC_015574	GTG	2	6	255206	255211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986464
4094	NC_015574	T	6	6	255212	255217	0 %	100 %	0 %	0 %	333986464
4095	NC_015574	AGT	2	6	255308	255313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986464
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4097	NC_015574	CAT	2	6	255403	255408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986464
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4100	NC_015574	AGA	2	6	255489	255494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986464
4101	NC_015574	GAA	2	6	255518	255523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986464
4102	NC_015574	GATTT	2	10	255524	255533	20 %	60 %	20 %	0 %	333986464
4103	NC_015574	GGGT	2	8	255602	255609	0 %	25 %	75 %	0 %	333986464
4104	NC_015574	A	7	7	255635	255641	100 %	0 %	0 %	0 %	333986464
4105	NC_015574	TAT	2	6	255778	255783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986464
4106	NC_015574	GAT	2	6	255792	255797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986464
4107	NC_015574	AAT	2	6	255996	256001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986465
4108	NC_015574	ATT	2	6	256025	256030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986465
4109	NC_015574	CTG	2	6	256060	256065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986465
4110	NC_015574	TCA	2	6	256157	256162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986465
4111	NC_015574	GGGA	2	8	256215	256222	25 %	0 %	75 %	0 %	333986465
4112	NC_015574	TGT	2	6	256278	256283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986465
4113	NC_015574	CTG	2	6	256332	256337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986465
4114	NC_015574	TGC	2	6	256411	256416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986465
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4117	NC_015574	TAT	2	6	256534	256539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986465
4118	NC_015574	GT	3	6	256688	256693	0 %	50 %	50 %	0 %	333986465
4119	NC_015574	AGT	2	6	256701	256706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986465
4120	NC_015574	TGT	2	6	256741	256746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986465
4121	NC_015574	ATT	2	6	256802	256807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986465
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4123	NC_015574	AAG	2	6	257347	257352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986466
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4243	NC_015574	AATG	2	8	265812	265819	50 %	25 %	25 %	0 %	333986471
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4491	NC_015574	AAGA	2	8	282223	282230	75 %	0 %	25 %	0 %	333986489
4492	NC_015574	A	6	6	282253	282258	100 %	0 %	0 %	0 %	333986489
4493	NC_015574	A	6	6	282370	282375	100 %	0 %	0 %	0 %	333986489
4494	NC_015574	GAAA	2	8	282536	282543	75 %	0 %	25 %	0 %	333986490
4495	NC_015574	TAA	2	6	282548	282553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
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4497	NC_015574	AGC	2	6	282593	282598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986490
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4499	NC_015574	TTG	2	6	282678	282683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986490
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